В 2011-2012 учебном году Петрозаводский госуниверситет планирует подать заявку на открытие 13 новых программ бакалавриата и магистратуры. Также в планах университета заявить две программы дополнительного профессионального образования. Сегодня Петрозаводский университет сохраняет свои позиции в двадцатке лучших классических университетов Национального рейтинга российских вузов. Кроме того, ПетрГУ занимает первое место по критерию «Интернационализация» и шестое - в номинации «Бренд». Среди вузов Северо-Западного федерального округа по итогам открытого конкурса по государственной поддержке программ развития инновационной инфраструктуры Петрозаводский университет занял четвертое место.